新劳动法生效后,公司以服务年限扣赔偿金,请问这种情况我申请劳动仲裁的胜算有多大？

各位律师：
你们好！我上个月向公司提出辞职，这个月10号发工资（3月工资），发现工资单上只剩下60多元，其他扣减扣了2千多。公司人事部说这是以工资抵扣赔偿金，但公司方面并没有任何通知，也没有书面计算赔偿金额给我。请问公司这样的做法是否合法？我应该怎样做？
另外，之前我询问过赔偿金的问题，我是毕业前与公司签订毕业生就业协议，同时签了公司方面的一份就业协议，上面约定服务不满一年要赔偿公司5000元培训费，但在职期间公司并未提供任何技能培训，亦不能提供培训发票，新劳动法生效后，公司以服务年限扣赔偿金，请问这种情况我申请劳动仲裁的胜算有多大？
希望得到解答，谢谢！

我个人认为,新劳动合同法第97条的分歧意见会很大,胜算不大.