具体该怎么操作,没有任何单位愿意出证明证明两人分居,在法律上如何认定这一事实？

咨询一个问题：我有一位朋友，她和丈夫关系一直不好，小孩子出生后不久就完全由女方父母抚养，目前小孩子已经上小学二年级了，丈夫很少过问，根本就没有尽做父亲的责任．夫妻之间经常吵架，到现在分居已经两年多了，去年春节前女方回自己父母家，夫妻之间再次闹矛盾，女方坚持提出离婚，男方看没有和好的可能，最后在离婚协议书上签了字．可是由于男方父亲的反对，男方又改变了主意，又不同意了离婚．事情已经拖了一年，打算今年年底前把这件事情解决好．按照婚姻法，分居两年应该可以申请离婚，请问具体该怎么操作？没有任何单位愿意出证明证明两人分居，在法律上如何认定这一事实？谢谢！

协议不成的，可以向法院提起离婚诉讼，是否分居两年，需要提供证据证明的