m6A RNA甲基化片段富集试剂盒用途和相关研究方案

用途：

m6A RNA甲基化片段富集试剂盒旨在富集RNA含有来自低输入RNA的m6A的片段，并通过PCR或谱鉴定区域特异性m6A通过使用Illumina平台或其他方法进行下一代测序，获得表转录体宽度m6A。该套件的创新工作原理、优化方案和组件允许捕获m6A片段具有最小的非特异性背景水平。富集的RNA适合于快速构建非条形码（单路）和条形码（多路）库，允许m6A区域以较小的偏差和高分辨率被映射。

输入量：

通常情况下，每个反应的总RNA量范围为1µg至20µg。对于最佳制备，输入量应为10µg RNA，但数据可从使用该试剂盒，总RNA低至500ng。

起始材料：

起始材料可以包括各种哺乳动物细胞样品，如培养物来自烧瓶或平板的细胞、从血液、体液和新鲜/冷冻组织、从整个细胞群和胚胎细胞中分选的特定细胞等。

目前，有几种方法用于表转录体范围的m6A映射。这些方法包括MeRIP、PA-m6A-seq、miCLIP和m6A CLIP。MeRIP已被广泛使用，但无法实现m6A剖面中的高分辨率。PA-m6A-seq、miCLIP和m6A CLIP提高了剖面分辨率但再现性差，工艺复杂。特别是，这些方法耗时（>2天）且成本高昂。为了解决这些问题，EpigenTek开发了一种新方法：切割并运行M6A富集（在靶下切割并使用核酸酶回收M6A富集）。

m6A RNA甲基化片段富集试剂盒组分：

抗体：

艾美捷m6A RNA甲基化片段富集试剂盒中使用的抗m6A兔多克隆抗体对m6A具有高度特异性RNA片段，MeRIP级，不与腺嘌呤非甲基化RNA片段交叉反应。

内部控制：

本试剂盒中提供了阳性对照。

注意事项：

为避免交叉污染，小心地将样品或溶液移到试纸条中井。使用气溶胶屏障移液管吸头，并始终在液体转移之间更换移液管的吸头。穿在整个过程中戴手套。如果手套与样品接触，更换手套立即。

m6A RNA甲基化片段富集试剂盒相关研究：

RNA甲基化定量

P-9003甲基安培™ RNA二硫化物转化试剂盒

P-9005 EpiQuik™ m6A RNA甲基化定量试剂盒（比色法）

P-9008 EpiQuik™ m6A RNA甲基化定量试剂盒（荧光法）

P-9010甲基闪光™ m6A DNA甲基化ELISA试剂盒（比色法）

P-9015甲基闪光™ 尿N6甲基腺苷（m6A）定量试剂盒（比色法）

P-9016 EpiNext™ 切割和运行RNA m6A序列试剂盒

DNA分离和清理

P-1003装配放大器™ 普通组织切片DNA分离试剂盒

P-1004装配放大器™ 血浆/血清DNA分离试剂盒

P-1006 DNA浓缩试剂盒

P-1009装配放大器™ 石蜡组织切片DNA分离试剂盒

P-1017装配放大器™ 尿液DNA分离试剂盒

P-1018装配放大器™ 血液和培养细胞DNA提取试剂盒

DNA富集反应

P-1015甲基安培™ 甲基化DNA捕获（MeDIP）试剂盒

P-1038 EpiQuik™ 羟甲基化DNA免疫沉淀（hMeDIP）试剂盒

P-1052 EpiQuik™ MeDIP Ultra套件

P-2002 EpiQuik™ 染色质免疫沉淀（ChIP）试剂盒

P-2003 EpiQuik™ 组织染色质免疫沉淀（ChIP）试剂盒

2014年上半年EpiQuik™ 工厂ChIP套件

P-2025 ChromaFlash™ 一步ChIP套件

P-2026 ChromaFlash™ 一步磁性ChIP套件

P-2027 ChromaFlash™ ChIP Ultra套件

P-2030 EpiNext™ ChIP Seq高灵敏度试剂盒

PCR分析

P-1029 EpiQuik™ 定量PCR试剂盒

DNA文库准备

P-1051 EpiNext™ DNA文库制备试剂盒（Illumina）

P-1053 EpiNext™ 高灵敏度DNA文库制备试剂盒（Illumina）

NGS条形码

P-1060 EpiNext™ NGS条形码（索引）集-12