所以以你的工作年限补缴部分会比较多,这部分都会从最终的结算工资中扣除,请问这样是否合理？

你好，王轶律师！
　　合同期内公司告知在节后解聘，公司补偿一月工资，但不是按自己的实际工资算的，在我提出劳动法时时公司这样答复：
2007年3月26日入职不满2年，所以赔偿1个月工资。工资本来就是不到2000，其余是外包员工的差费和补助费（签合同时因公司提出避税，所以没有写明工资，但当初谈的每月发的就只基本工资，公司所有外包员工都是这样），此工资表是在相关部门备了案的。根据劳动法赔偿金的工资是不含差费的。
即便通过劳动仲裁认为你的工资超过2000，那超过2000的部分是需要补缴个人所得税的，个人所得税的性质决定那是由个人承担，公司代扣，所以以你的工作年限补缴部分会比较多，这部分都会从最终的结算工资中扣除。请问这样是否合理？如果是劳动仲裁认为工资超过2000，（如果前期没交）是否补缴个人所得税。
谢谢！

就算扣缴个税数量也比较小。