我觉得劳动局有问题,不是在维护劳动者的利益而是在维护企业的利益,请问我该怎么办？

1，我07年5月到这个单位的，试用期3个月工资800元，试用期过后1000元，但是单位老板答应我发800从9月至12月每月扣得200年底给我，工资表上有还有业务经理也知道这件事情。
2，但是到年底不给了。我去了劳动局，但是劳动局的科长说以前是两个股东，以前的一个股东11月18日把资金抽走了但是债务还在，我的工资还是要付得，我是给公司打工的不是给个人打工的。
3，可是劳动局的科长非说前面走的股东付我8，9，10月工资。后面是现在负责人付工资。
4，我觉得这样不合理，而且只是资金拿走，法人代表没换。我觉得他们股东有矛盾跟我没有关系，我给公司打工的，我只想拿我该得到的，我觉得劳动局有问题，不是在维护劳动者的利益而是在维护企业的利益，请问我该怎么办？

申请劳动仲裁，不服可以起诉。