我有何途径反驳回时效过期的,另向这种情况,我作为员工如何维护自已的权益？

各位律师：
我于2000进入某公司试用3个月后转为正式工，
工作到2004时由于工作需要外出学习1年签订了培训协议，05年回公司后又试用6个月，才进入岗位，然而勾心斗角严重并且处处为难我后，我从身体到精神受伤严重后，口头请假处出看病，回后工作岗位也没了，而是做车工，根本没按培训协议要求来做，2006年8月我感觉不适后就没有上班回去休息看病检查，至今没有上班，（但我与此公司的劳动关系还存在）。
而现在我进行仲裁，仲裁员以为上岗通知上的时间为由说时效过期，不给予受理。
备注：
一，有跟此公司的培训协议并没有解除，
二，我还是此公司的长期合同工，是为原来国有正式工转成的。
三，我并没有收到开除通知书。
请问我有何途径反驳回时效过期的，另向这种情况，我作为员工如何维护自已的权益？

到法院起诉。