3万RMB,请问各位青天,公司的这一做法合法吗？

我07年6月份到一家做国外工程的单位上班，当时签的是一年期的协议，其中只约定了协议期限和国内工资部分，8月份我被派到了国外项目部，08年1月份，由于国外项目部管理混乱，我自己提出辞职回国，在领国外工资的时候，发现扣掉了往返机票和办理签证的相关手续费用共计1.3万RMB。
请问各位青天，公司的这一做法合法吗？请为我支招。

应在劳动合同中就此费用进行约定，未约定的单位不应收取，你履行的是职务行为！