但这是两个不同的项目,虽然已判决了就应该生效,而且公司已过了上诉期啊,我现在不知该怎么办？

公司现在是以不存在劳动关系为由告上法庭的，因为劳动仲载委判决后，他又上诉，法院维持原判后，他已不上诉。但过了三个月后公司把我告上法院。是以另一个项目说不存在劳动关系。因为我们告公司的项目是交纳社保(已判决公司应交)。税务机关说要等判决后才可以，但这是两个不同的项目，虽然已判决了就应该生效，而且公司已过了上诉期啊！我现在不知该怎么办？

判决已生效,可以申请执行.