只有当时签的那份借款协议,我很着急,不知道这协议能作为证据吗,如果不能,我该怎么办？

我于2000年投资18000元做生意，当时由于我的年纪比较大，所以聘请了我的侄子给我帮忙，店内的一切事情都由他经手并且记帐，后来，我把店直接转给了他，我又给他了2000元，加上我投的18000，总共是20000元，我们两个就这两万元签了一份借款协议，协议上面说让他于2000年年底归还，若还不上，就限两年内还上，同时连本带息一块还，若到那时还还不上，我们双方再商量还款日期及规定。然后我们双方在协议上签了字，按了手印，但后来由于种种原因，我们至今未曾见一面，更不用说还钱一事，现在，他想不认帐，我想直接起诉他，但我的证据很少，只有当时签的那份借款协议，我很着急，不知道这协议能作为证据吗？如果不能，我该怎么办？

你的证据确实不能完全证明借款，而且存在诉讼时效的问题。建议你寻找其他途径，比如要他返还你的店，以避开诉讼时效的问题。因为你叙述不是很清楚，律师也没法提供更详细的建议。