而我将要和单位之间订的合同(只会有单位的章子和我的签名)却要写两年,请问两个合同不一致时?

我和单位之间本来订的是两年,而厂长却说为了办保险让我在劳动局发的劳动合同上填长期
我由于不知道情况在上面填的是长期,而我将要和单位之间订的合同(只会有单位的章子和我的签名)却要写两年,请问两个合同不一致时,哪个有效

经过劳动局备案的有效。