上海本轮已经监测到30个奥密克戎亚型毒株,各大医院高位运行
2022年12月29日,上海交通大学附属瑞金医院陈赛娟教授团队与上海市公共卫生临床中心范小红教授团队联合在《Frontiers of Medicine》杂志上发表了“Primary assessment of the diversity of Omicron sublineages and the epidemiologic features of autumn/winter 2022 COVID-19 wave in Chinese mainland”文章。
该团队随机选取了2022年11月15日到2022年12月22日期间上海地区新冠病毒感染样本369例。通过全基因组测序技术对上述样本的序列进行鉴定分析。在GISAID(Global Initiative on Sharing All Influenza Data,,全球共享流感数据倡议组织)数据库中检索发现,上述369例样本感染病毒包括30个亚型。绝大多数患者(355/369;95.5%)感染的亚型类群集中在5个奥密克戎亚系。
奥密克戎主要亚型
主要毒株包括已报道在北京和广州等地流行的BF.7和BA.5.2和近期欧美地区出现的BQ.1和XBB。结合患者旅居史,从海外入境上海的感染者主要携带BQ.1和XBB。
目前上海底物尚未发现新型新冠病毒突变毒株!根据2022年12月26日,中国CDC病毒所所长许文波教授,在接受央视采访时披露的数据显示:奥密克戎亚型BA5.2和BF.7目前是国内这一波疫情的主要毒株,合计感染超过80%人群。一共发现31个奥密克戎亚分支输入国内,其中也包括正在国外加速传播的BQ.1、XBB等亚分支。
老年或者和男性患者发展为重症/危重症的风险显著增高;从下图可以看出,感染人数和危重症患者数量呈现显著的相关性。
全国各大城市感染达峰趋势
上海各大医院高位运行:门诊下降、急诊猛增
瑞金医院
“随着新冠感染者数量的增多,重症高峰已经慢慢出现了,急诊压力很大,人手很紧张。” 发热门诊的就诊量出现了下降趋势,从以往的600人次/天已降至300人次/天,但急诊的就诊量出现明显增长,较之前翻倍,达到了1500人次/天。
仁济医院
连日来120接诊量逐日攀升,东院和南院两个院区12月28日一天共接到269辆救护车,位居全市市级医院前列。“其中,东院区急诊就诊量已达1500人次/天,南院区急诊量也在1000人次/天。”
春运期间人员流动加剧疫情传播
随着春运的临近,国内将出现大规模的人员流动,势必会加剧不同地区之间奥密克戎毒株的交叉感染,进一步加剧疫情发展。2022年12月29日,国务院印发《2023年综合运输春运新型冠状病毒感染疫情防控指南》对春运期间的疫情防控提供了指导意见:核心还是坚持佩戴口罩,尽可能减少人员流动引起的疫情传播,尤其加强对高危人群的防护。
关于GISAID数据库:
建立于2008年5月,是由全世界一些较权威的医学科学家组建,致力于改善流感数据的共享。目前GISAID上已经存放了超过58万条来自世界各地实验室的新冠病毒序列数据。除了序列信息外,GISAID还提供序列的meta数据,包括病毒采集的地方和日期,序列提交的时间,序列的质量,提交的实验室等。
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