3、追溯期60天时什么意思？

尊敬的律师你好：
我是2006年7月毕业到现在公司的。
1、到公司后公司规定一个月上30天班（据说劳动法规定每月最多加班为72小时）。4天发加班工资，四天算调休（想调休时基本不批，除非丧假，结婚，考试，一次调休超过4天还要扣当月加班工资，去年我累计了几十天调休都作废了）。法定节假日如10.1、5.1照常上班，不发加班工资，春节放假按未上班算。公司文件规定的年休假、婚假、探亲假都没有兑现。另外每天经常加班到23点。（加班天数工资表上有注明，可以做证据。每天加班时间没证据）
2、公司在我进入公司时一次性给了我8000安家费和5000助学金。
3、公司在合同上规定必须干满6年不然返还8000+3000=13000另付10000违约金。总共23000。另外公司并没有给我做任何培训。
4、我现在实在受不了无休止的加班想辞职。因为一旦辞职公司会以扣押档案与保险为由威胁。感觉签的合同像卖身契。
根据以上情况我的问题是
如果我要辞职。要走什么样的程序获得最大的利益
1、我能不缴23000又拿到档案么？
2、比如说我是先写辞职信等一个月后他不退还我档案为由上告他还是现在就直接上告他。
3、追溯期60天时什么意思？
4、我能不能让他赔偿到时候扣我档案

公司违反劳动法明显，也是合同无法履行的关键。既然你不打算继续干，不如将公司诉至劳动仲裁部门，要求公司承担违约责任，支付你相关费用，履行相应义务。