还要还要处以发款,我想请问一下,这样的处理合理吗,希望各位帮我解答一下,如果不合理我该怎么办呢？

我于2004年4月到河北某有限应聘工作，到08年的7月份，公司由于工作需要让我去参见天车技能培训，并签定培训协议，当培训完成并取得从业资格证后公司调我到一个与培训内容好无关联的工作岗位上去，到该岗位工作以后，车间领导对该岗位工作所有人员态度非常恶劣，并经常不按规定的时间提前上班，并对该岗位人员进行辱骂7月11号这天，车间领导开会研究决定，说明公司作息时间是给领导制定的，员工就的听从指挥，并说如果以后延时加班，加班工资一分钱没有，如果愿意干的就无条件服从，不愿意的就明天找人力资源部或者劳资，可是我们去找的时候公司以我们不服从指挥为由，要扣取我的单方违约金和培训费，当时条件苛刻，我没同意，以后公司从未通知过我，可我今天也就是8月12号去找他们的时候，他们说由于我没履行离职手续公司给予除名处理，这段时间按旷工处理，除了扣除培训费，违约金以外，还要还要处以发款，我想请问一下，这样的处理合理吗？希望各位帮我解答一下，如果不合理我该怎么办呢？

还是申请仲裁为好。