应经劳动保障部门批准″这们这样扣50%原工资作为绩效考核,劳动保障部能批准吗？

胡律师您好！
我在一家公司上班，我服务了三年，09年签了合同，三年的合同，我工资三千多/月薪，而在合同计时工资栏：已方正常工作时间工资按″本公司工资制度″执行，初始工资额为2000元/月，而″本公司工资制度″是要扣50%作为绩效，相当于只能发放三千元的一半工资，而不能发初始工资2000元/月，这样是不是合理的，别外制定的″本公司工资制度″，拿50%作为绩效，有这种做法吗？这样做合理吗？
还有的时，我们的劳动合，前年签时，有鉴证机构盖章，鉴证人签名，而今年合同此栏没有鉴证机构签名盖章，这样做合法吗？
还有，合同首页注有：实行不定时，综合计算工时工作制的，应经劳动保障部门批准″这们这样扣50%原工资作为绩效考核，劳动保障部能批准吗？

工资可以按照你们实际发放标准确定。没有鉴证的合同同样是合法有效地合同。