如甲方需长期调动乙方的工作岗位,双方应协商一致签订新劳动合同加以确认),请问公司这样做合法吗？

各位律师：
我在一家电子厂，任工程师一职．在2008年1月3日至2010年1月3日签了三年合同，合同中的工作岗位为工程师．公司领导想让我自动辞职调离我到产线做组长．(但公司合同中有一条说甲方因工作需要，有权临时调动(三个月内)乙方的工作岗位，乙方应当服从。如甲方需长期调动乙方的工作岗位，双方应协商一致签订新劳动合同加以确认)。请问公司这样做合法吗？我不同意调离工作岗位该怎样申请劳动仲裁．谢谢回复！

不合法，可以申请劳动仲裁。书写申诉状，递交至劳动部门劳动争议仲裁科。