而且离开的时候还办理了交接手续,交接单上有老板的签名,请问我现在应该承担这些责任吗？

我之前在一家公司做财务，因为当时老板指使我叫别的工厂虚开发票给我们拿去抵扣进项税，以达到偷税的目的。如果找不到就扣我半个月的工资，我有一个月没有找到就被扣了1000块呢。虚开数额很大，现在税务局查到了哪些虚开的发票，公司负责人说都是我一手在办，他们并不知情，起诉我了，说当时报送报表都是我经办的。我已经离开公司半年多了，而且离开的时候还办理了交接手续，交接单上有老板的签名。请问我现在应该承担这些责任吗？

如果你不能证明是老板指使的，那么你的责任非常大，由于取证技巧性强，建议及时委托律师处理，做好应诉准备。