现在已经三年了,还可以起诉吗,我该怎么办？

我姥姥，老爷曾与其侄子签定一份协议他们的房屋有其侄子继承，老爷去世后在姥姥在世的前提下，其侄子私自拆除姥姥房子并在姥姥宅基地盖起了新房子并不允许姥姥进门。
现在已经三年了，还可以起诉吗？我该怎么办？

可以让你姥姥起诉，依《继承法》取消他的继承权。具体可咨询或聘请当地律师。