两年内不主张自己权利的,不是已过诉讼时效了吗？

各位律师：
根据最高人民法院<关于审理民事案件适用诉讼时效制度若干问题的规定>″ 认为债权请求权以财产利益为内容，不具支配性。若权利人长期怠于行使权利，会使法律关系处于不确定状态，不利于维护社会交易秩序稳定，故债权请求适用诉讼时效的规定″
民法通则规定：请求保护民事权利的诉讼时效期间为二年。两年内不主张自己权利的，不是已过诉讼时效了吗？

一、合同是否约定了打包价?如果没有约定，则按实际工程量结算。
二、工程是否已经竣工验收？如未约定工程款给付确定日期的，从竣工之日起计算诉讼时效，为两年。
三、工程款是否已经结算？如果已经结算清楚，则为工程欠款纠纷，适用两年的诉讼时效，从结算之日起计算。